Cyprofloksacyna ma szersze zastosowanie kliniczne niż norfloksacyna. Oprócz infekcji dróg moczowych, infekcji jelit, rzeżączki itp. Można go również stosować w leczeniu bakterii grypy, E. coli, pneumoniae, Proteus mirabilis, Proteus common, infekcji kości i stawów, infekcji skóry i tkanek miękkich oraz zapalenia płuc, posocznica itp. wywołana przez Profidens, M. bacillus, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter cloacae, C.riffis, Staphylococcus (w tym szczepy oporne na metycylinę) itp. Doustny preparat tego produktu jest zgodny z norfloksacyną; podawanie dożylne może być stosowane w leczeniu ciężkich zakażeń, takich jak posocznica bakteryjna enterobacteriaceae, zakażenie płuc, jama brzuszna, zakażenie dróg żółciowych i tak dalej.
